MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi A str. AKU_12601 chromosome

Total Repeats: 80227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011147	CAC	3	9	243	251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361213
2	NC_011147	ACC	2	6	256	261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361213
3	NC_011147	CGG	2	6	393	398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361214
4	NC_011147	ACCA	2	8	505	512	50 %	0 %	0 %	50 %	197361214
5	NC_011147	TGG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361214
6	NC_011147	GAT	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361214
7	NC_011147	A	6	6	530	535	100 %	0 %	0 %	0 %	197361214
8	NC_011147	CGG	2	6	540	545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361214
9	NC_011147	T	6	6	584	589	0 %	100 %	0 %	0 %	197361214
10	NC_011147	GC	3	6	614	619	0 %	0 %	50 %	50 %	197361214
11	NC_011147	CTG	2	6	703	708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361214
12	NC_011147	CGC	2	6	732	737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361214
13	NC_011147	A	6	6	755	760	100 %	0 %	0 %	0 %	197361214
14	NC_011147	GATC	2	8	816	823	25 %	25 %	25 %	25 %	197361214
15	NC_011147	CTG	2	6	835	840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361214
16	NC_011147	CGC	2	6	897	902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361214
17	NC_011147	TGG	2	6	971	976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361214
18	NC_011147	CCG	3	9	1004	1012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361214
19	NC_011147	GCC	2	6	1018	1023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361214
20	NC_011147	CTG	2	6	1038	1043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361214
21	NC_011147	CT	3	6	1144	1149	0 %	50 %	0 %	50 %	197361214
22	NC_011147	CGA	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361214
23	NC_011147	AAC	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361214
24	NC_011147	GAT	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361214
25	NC_011147	GGC	2	6	1368	1373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361214
26	NC_011147	CGC	2	6	1383	1388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361214
27	NC_011147	GGT	2	6	1410	1415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361214
28	NC_011147	TCC	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197361214
29	NC_011147	TG	3	6	1456	1461	0 %	50 %	50 %	0 %	197361214
30	NC_011147	GC	3	6	1475	1480	0 %	0 %	50 %	50 %	197361214
31	NC_011147	CCG	2	6	1485	1490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361214
32	NC_011147	GCT	2	6	1530	1535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361214
33	NC_011147	TGT	2	6	1575	1580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361214
34	NC_011147	TTC	2	6	1621	1626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361214
35	NC_011147	CAATAT	2	12	1644	1655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	197361214
36	NC_011147	TCT	2	6	1675	1680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361214
37	NC_011147	TGG	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197361214
38	NC_011147	ACG	2	6	1709	1714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361214
39	NC_011147	CCA	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361214
40	NC_011147	CGG	2	6	1794	1799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361214
41	NC_011147	CGG	2	6	1803	1808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361214
42	NC_011147	GAA	2	6	1848	1853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361214
43	NC_011147	GT	3	6	1871	1876	0 %	50 %	50 %	0 %	197361214
44	NC_011147	GCG	2	6	1877	1882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361214
45	NC_011147	ATC	2	6	2006	2011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361214
46	NC_011147	TTG	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197361214
47	NC_011147	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361214
48	NC_011147	ACT	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361214
49	NC_011147	CGC	3	9	2157	2165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361214
50	NC_011147	CTG	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361214
51	NC_011147	TGA	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361214
52	NC_011147	CT	3	6	2293	2298	0 %	50 %	0 %	50 %	197361214
53	NC_011147	TC	3	6	2331	2336	0 %	50 %	0 %	50 %	197361214
54	NC_011147	GC	3	6	2353	2358	0 %	0 %	50 %	50 %	197361214
55	NC_011147	CG	3	6	2384	2389	0 %	0 %	50 %	50 %	197361214
56	NC_011147	GAC	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361214
57	NC_011147	GCC	2	6	2563	2568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361214
58	NC_011147	TGA	2	6	2586	2591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361214
59	NC_011147	AGGTA	2	10	2592	2601	40 %	20 %	40 %	0 %	197361214
60	NC_011147	TAT	2	6	2725	2730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361214
61	NC_011147	TGC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361214
62	NC_011147	ATG	2	6	2771	2776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361214
63	NC_011147	CGG	3	9	2780	2788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361214
64	NC_011147	AGC	2	6	2956	2961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361215
65	NC_011147	GCC	2	6	3007	3012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361215
66	NC_011147	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	197361215
67	NC_011147	CGT	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361215
68	NC_011147	CGC	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361215
69	NC_011147	ATGA	2	8	3167	3174	50 %	25 %	25 %	0 %	197361215
70	NC_011147	GCA	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361215
71	NC_011147	TGA	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361215
72	NC_011147	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361215
73	NC_011147	ATT	2	6	3317	3322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197361215
74	NC_011147	CAG	2	6	3326	3331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361215
75	NC_011147	TGA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361215
76	NC_011147	ATTGC	2	10	3435	3444	20 %	40 %	20 %	20 %	197361215
77	NC_011147	GCC	2	6	3503	3508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361215
78	NC_011147	TGA	2	6	3513	3518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361215
79	NC_011147	CG	4	8	3542	3549	0 %	0 %	50 %	50 %	197361215
80	NC_011147	GC	3	6	3597	3602	0 %	0 %	50 %	50 %	197361215
81	NC_011147	CGG	2	6	3744	3749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361215
82	NC_011147	AGT	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361215
83	NC_011147	CAG	2	6	3848	3853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361216
84	NC_011147	T	8	8	3858	3865	0 %	100 %	0 %	0 %	197361216
85	NC_011147	TGA	2	6	3901	3906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361216
86	NC_011147	GCA	2	6	3976	3981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361216
87	NC_011147	CG	3	6	4001	4006	0 %	0 %	50 %	50 %	197361216
88	NC_011147	AG	3	6	4039	4044	50 %	0 %	50 %	0 %	197361216
89	NC_011147	CGG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361216
90	NC_011147	GCG	2	6	4137	4142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361216
91	NC_011147	CGGCG	2	10	4183	4192	0 %	0 %	60 %	40 %	197361216
92	NC_011147	GTC	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361216
93	NC_011147	CG	3	6	4245	4250	0 %	0 %	50 %	50 %	197361216
94	NC_011147	GGC	2	6	4292	4297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361216
95	NC_011147	TGA	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361216
96	NC_011147	GAA	2	6	4370	4375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361216
97	NC_011147	GCC	2	6	4422	4427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361216
98	NC_011147	CTA	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361216
99	NC_011147	CTG	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361216
100	NC_011147	CGC	2	6	4582	4587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361216
101	NC_011147	GATG	2	8	4672	4679	25 %	25 %	50 %	0 %	197361216
102	NC_011147	CAGC	2	8	4681	4688	25 %	0 %	25 %	50 %	197361216
103	NC_011147	GGA	2	6	4708	4713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197361216
104	NC_011147	CCG	2	6	4720	4725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361216
105	NC_011147	CTGA	2	8	4739	4746	25 %	25 %	25 %	25 %	197361216
106	NC_011147	GCG	2	6	4757	4762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361216
107	NC_011147	GAT	2	6	4766	4771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361216
108	NC_011147	ACA	2	6	4780	4785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361216
109	NC_011147	GCG	2	6	4832	4837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361216
110	NC_011147	AAAG	2	8	4919	4926	75 %	0 %	25 %	0 %	197361216
111	NC_011147	GCT	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361216
112	NC_011147	CAT	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361216
113	NC_011147	CTGC	2	8	5009	5016	0 %	25 %	25 %	50 %	197361216
114	NC_011147	GCC	2	6	5024	5029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197361216
115	NC_011147	ATG	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361216
116	NC_011147	TCA	2	6	5202	5207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361217
117	NC_011147	AAT	2	6	5267	5272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197361217
118	NC_011147	TCA	2	6	5281	5286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361217
119	NC_011147	CG	3	6	5290	5295	0 %	0 %	50 %	50 %	197361217
120	NC_011147	T	6	6	5297	5302	0 %	100 %	0 %	0 %	197361217
121	NC_011147	ACC	2	6	5316	5321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361217
122	NC_011147	TCA	2	6	5340	5345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197361217
123	NC_011147	TTC	2	6	5379	5384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361217
124	NC_011147	CAC	3	9	5423	5431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361217
125	NC_011147	CG	3	6	5509	5514	0 %	0 %	50 %	50 %	197361217
126	NC_011147	AG	3	6	5591	5596	50 %	0 %	50 %	0 %	197361217
127	NC_011147	CAAAAT	2	12	5617	5628	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	197361217
128	NC_011147	CGT	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361217
129	NC_011147	GCG	2	6	5794	5799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197361217
130	NC_011147	GCT	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197361217
131	NC_011147	AATCAG	2	12	5912	5923	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197361217
132	NC_011147	CG	3	6	6010	6015	0 %	0 %	50 %	50 %	197361218
133	NC_011147	ACC	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197361218
134	NC_011147	CAA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197361218
135	NC_011147	A	6	6	6305	6310	100 %	0 %	0 %	0 %	197361218
136	NC_011147	CGA	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197361218
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142	NC_011147	GAT	2	6	6803	6808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361218
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144	NC_011147	GAT	2	6	6854	6859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197361218
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153	NC_011147	CCGCG	2	10	7223	7232	0 %	0 %	40 %	60 %	197361218
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259	NC_011147	AGA	2	6	13123	13128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361224
260	NC_011147	TCT	2	6	13143	13148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197361224
261	NC_011147	GAA	2	6	13161	13166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361224
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263	NC_011147	GAA	2	6	13284	13289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197361224
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392	NC_011147	CGA	2	6	22352	22357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449784909
393	NC_011147	TGGC	2	8	22421	22428	0 %	25 %	50 %	25 %	449784909
394	NC_011147	CGG	2	6	22453	22458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449784909
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